项目包含两个基地：生物柴油及衍生产品生产基地和生物柴油研发基地。其中生物柴油及衍生产品生产基地以深圳东域为投资和招商主体，计划建设高技术能源植物种苗克隆生产厂、生物柴油提炼厂、清洁能源配送中心、利用能源植物进行提取的医药原料生产厂及其他衍生产品生产厂。生物柴油研发基地由深圳东域牵头、联合武汉大学、中科院版纳植物园作为主要技术依托单位组建，下设生物能源开发研究院、能源植物引种实验基地和能源植物标准化种植示范基地，其中生物能源开发研究院包含能源植物基因技术开发部、生物柴油及衍生产品技术开发部、武汉大学产学研基地，在条件成熟时申请成立国家生物柴油工程研究中心和博士后流动工作站。